在PCR实验中,探针是一种关键的工具,用于增强实验的特异性和灵敏度,因此探针在检测中被广泛地使用。
探针是一段与目标DNA或RNA序列互补的寡核苷酸,通常包含一个荧光基团和一个淬灭基团。在PCR反应中起到特异性识别和信号放大的作用。在PCR扩增过程中,探针与目标DNA或RNA结合,当PCR酶(如Taq酶)在延伸阶段切割探针时,释放出荧光基团,从而允许荧光检测器检测到荧光信号。
探针种类众多,有TaqMan探针、分子信标、双杂交探针、小凹槽结合剂(MGB)探针、蝎形探针、LUX探针等,均依赖于某种形式的共价连接的荧光淬灭基团分子,该分子在特定目标序列存在时被释放。
探针如何适配PCR仪:
一、明确荧光基团
首先,您需要明确所使用的探针对应的荧光基团。不同类型的探针会使用不同的荧光报告基团和淬灭基团这些信息通常可以在探针供应商提供的产品说明书中找到,确认其激发波长和发射波长的大致范围。以下是一些常用的荧光基团及其对应的激发波长(Ex)和发射波长(Em)
二、对比qPCR仪滤光片
若不在表1的范围内,理论上,只要探针所使用的荧光基团的激发波长和发射波长跟仪器的滤光片的设置相配即可,就是只要最终荧光信号在仪器的检测范围内,结果都可以被检出。